Der Hauptsitz der Denkmal Stiftung Thurgau ist das Bauteillager in Schönenberg an der Thur. Aktuell sind zwei weitere Standorte für die Denkmal Stiftung Thurgau von grosser Bedeutung. Einerseits die Fischerhäuser in Romanshorn, die bereits restauriert sind und für Ferien im Baudenkmal vermietet werden. Andererseits steht in Tägerschen der ehemalige Freisitz (Schloss), der im Besitz der Denkmal Stiftung Thurgau ist und restauriert wird.